该片改编自士郎正宗的同名科幻漫画，讲述了在“平行世界”的2029年，全世界被庞大信息网络连为一体，人类的各种组织器官均可被人造化，各种新型的犯罪事件也随之产生，日本国家公共安全委员成立下属秘密行动小组“攻壳机动队”，专门解决这类事件的故事。