在复仇者联盟众英雄的努力下，于灭霸无限手套事件中化作为灰烬的人们重新回到了人世间，曾经消失的蜘蛛侠也回归到了普通的生活之中。数月后，彼得·帕克所在的学校举行了欧洲旅游，帕克也在其中。在欧州威尼斯旅行时，一个巨大无比的水怪袭击了威尼斯。不敌敌人的蜘蛛侠幸得一位自称“神秘客”的男子搭救才击退敌人。之后，神盾局局长找上正在旅游的彼得·帕克并要求其加入神盾局，并安排神秘客协助帕克。神秘客自称来自其他宇宙，并告知一群名为元素众的邪恶势力已经入侵这个宇宙了。为了守护来之不易的和平，蜘蛛侠决定与神秘客联手。然而在神秘客那头罩之中，似乎隐藏着什么不为人知的真相。